WGS e PCR em tempo real – parceiros, não concorrentes

Como o Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) e a PCR em Tempo Real Estão Moldando a Nova Era da Segurança dos Alimentos.

Com o Regulamento (UE) 2025/179, a União Europeia torna obrigatório o uso do Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) para certos patógenos transmitidos por alimentos a partir de 23 de agosto de 2026:

Listeria monocytogenes
Salmonella enterica
E. coli
Campylobacter jejuni
Campylobacter coli

Isso se aplica quando esses patógenos estiverem ligados a um surto de origem alimentar, ou quando essa ligação for suspeita.

O objetivo é estabelecer um sistema pan-europeu de alerta precoce molecular capaz de detectar e resolver surtos transfronteiriços mais rapidamente.

Embora o WGS se torne o novo padrão para a rastreabilidade, a PCR em tempo real (ou real-time PCR) permanece a espinha dorsal operacional da análise diária — rápido, sensível e comprovado na prática.

WGS – A nova tecnologia de referência para rastreabilidade

O Sequenciamento do Genoma Completo (WGS) analisa o DNA completo de um microrganismo, detectando até as menores diferenças genéticas entre os isolados.

O resultado: uma impressão digital de cada patógeno. Esses dados permitem que autoridades e laboratórios em todo o mundo comparem cepas – independentemente de onde foram isoladas. Isso possibilita:

Detecção de clusters e investigação de surtos em tempo real
Bancos de dados de comparação globais (por exemplo, EFSA, ECDC, NCBI)
Melhoria na avaliação de risco e na identificação da fonte

O que a UE exige a partir de 2026?

De acordo com o Regulamento (UE) 2025/179, os Estados-Membros devem usar o WGS quando:

Um surto de origem alimentar for suspeito ou confirmado
Isolados de alimentos, animais, ração ou do ambiente estiverem ligados a esse surto

Isso afeta principalmente

Laboratórios nacionais de referência
Laboratórios regionais de alimentos e veterinários
Autoridades governamentais de inspeção de alimentos

As próprias empresas de alimentos não são obrigadas a realizar o WGS – mas devem fornecer isolados ou dados de sequência existentes mediante solicitação das autoridades.

A EFSA exige a submissão de dados específicos juntamente com as sequências WGS. Isso inclui identificadores de referência, a espécie do patógeno, a data da amostragem e o Estado-Membro onde a amostragem ocorreu, bem como uma descrição da fonte – seja ela alimento, animal, ração ou material ambiental. Os resultados do WGS devem ser encaminhados à EFSA prontamente assim que estiverem disponíveis.

PCR em Tempo Real – O Pilar Operacional da Segurança dos Alimentos

Apesar dos avanços tecnológicos, a PCR em tempo real continua sendo uma ferramenta fundamental para testes de rotina e rápidos. Ele oferece:

Resultados em horas em vez de dias
Alta sensibilidade
Protocolos padronizados
Fluxos de trabalho automatizáveis para altos volumes de amostras

Aplicações práticas incluem:

Testes de liberação (por exemplo, para produtos frescos ou prontos para consumo)
Monitoramento ambiental e de higiene (CIP, superfícies)
Controle de matéria-prima e avaliação de fornecedores

Do teste à estratégia – WGS e PCR em tempo real trabalhando junto

“A PCR em tempo real detectou. O WGS mostra de onde veio. A PCR em tempo real impede que aconteça novamente..”

Um sistema de teste à prova de futuro combina a PCR em tempo real e o WGS em um processo em camadas:

Triagem via PCR em tempo real – Detecção precoce de patógenos ou indicadores
Isolamento de culturas de amostras positivas – Base para análise posterior
Análise WGS de isolados relevantes – Para rastreabilidade, clustering e investigação de surtos

Isso garante que o WGS seja usado apenas quando necessário – e a PCR em tempo real permaneça a ferramenta de tomada de decisão econômica nas operações de rotina.

Para mais informações sobre teste de patógenos, acesse: https://food.r-biopharm.com/highlights/surefast-one-qpcr-kits-for-reliable-detection-of-food-pathogens-now-aoac-microval-certified/

Fontes: https://eur-lex.europa.eu/eli/reg_impl/2025/179/oj

https://food.ec.europa.eu/document/download/bb6b197a-cce2-4ebf-aca2-ebb6696c803f_en