Microbiologie, Virus - 22/08/2024

Augmentation hors saison des cas de norovirus

￭ Le norovirus est un virus très contagieux qui provoque des vomissements et de la diarrhée.
￭ Les huîtres contaminées sont une source fréquente d’épidémies.
￭ Une détection rapide est essentielle pour prévenir la propagation de la maladie.

Le norovirus reste une cause importante de maladies d’origine alimentaire dans le monde. En 2024, on a observé une augmentation des cas de norovirus, ce qui a conduit à un nouvel accent sur les mesures de détection et de prévention. Comprendre les modes de détection du virus, notamment par des méthodes basées sur la PCR en temps réel, est crucial pour minimiser le risque de contamination.
 
Le norovirus et son impact :
Le norovirus fait partie de la famille des Caliciviridae, connu pour provoquer une gastro-entérite, avec des symptômes tels que des nausées, des vomissements, de la diarrhée et des douleurs abdominales. Le virus est très contagieux et peut se propager par des aliments et de l’eau contaminés, par contact de personne à personne ou par contact avec des surfaces contaminées.
Les aliments crus, tels que les salades, les fruits (congelés), les crabes ou les crustacés peuvent être contaminés par des norovirus et provoquer des infections, ainsi que de l’eau et d’autres boissons contaminées. Cependant, la principale source est les mollusques bivalves contaminés (comme les huîtres) consommés crus ou insuffisamment cuits ainsi que les fruits et légumes.

 
L’augmentation des cas en 2024 :

Les maladies et les épidémies à norovirus sont généralement plus fréquentes pendant les mois d’hiver plus froids ;
Cette année, cependant, il y a eu une augmentation inhabituelle des cas de norovirus signalés en Europe et aux États-Unis, par rapport aux années précédentes. De plus, il y a eu une augmentation des notifications RASFF concernant les contaminations par les norovirus chez les mollusques bivalves par exemple.
 
Détection par PCR en temps réel du norovirus dans les aliments :
La détection précise du norovirus dans les produits alimentaires est essentielle pour contrôler les épidémies potentielles. La principale difficulté de la détection des contaminations virales dans les aliments est qu’elles sont souvent distribuées de manière hétérogène et ne se produisent qu’en très petites quantités de virus, qui peuvent toutefois déjà provoquer une infection et doivent donc être détectées de manière fiable. De plus, il est souhaitable de tester non seulement les aliments, mais aussi l’eau et les surfaces. L’utilisation de la PCR en temps réel est devenue une approche standard en raison de sa sensibilité et de sa spécificité.
SureFast® Norovirus/Hépatite A 3plex est un test PCR en temps réel détectant simultanément le norovirus et l’hépatite A. Les gènes cibles pour la détection du norovirus GGI/GGII et de l’hépatite A sont adaptés à la norme DIN EN ISO 15216-2.

 
Adapter la préparation de l’ARN pour différents types d’aliments :

L’un des défis de la détection du norovirus dans les aliments est la diversité des matrices alimentaires, ce qui nécessite des protocoles de préparation d’ARN personnalisés. Les différents aliments présentent des obstacles uniques pour la détection du virus, nécessitant des approches spécifiques.

• Produits frais : Pour des éléments comme la laitue et les baies, un processus de lavage et d’élution approfondi est nécessaire pour éliminer les virus liés à la surface, suivi d’une concentration pour améliorer la détection.
• Coquillages : Étant donné que les coquillages peuvent accumuler des virus à partir d’eau contaminée, l’homogénéisation des tissus et l’extraction minutieuse de l’ARN sont nécessaires pour garantir des résultats fiables.
• Aliments transformés : Les matrices alimentaires complexes, telles que celles des repas prêts à consommer, peuvent contenir des inhibiteurs qui affectent les performances de la PCR. L’ajustement des méthodes de préparation des échantillons peut améliorer la récupération de l’ARN.

En optimisant ces protocoles en fonction du type d’aliment, les laboratoires peuvent obtenir une détection plus précise des norovirus.

En savoir plus sur les protocoles de préparation d’échantillons et le kit PCR multiplex en temps réel détectant simultanément le norovirus (génogroupes I et II) et l’hépatite A : SureFast® Norovirus/Hépatite A 3plex

L’augmentation des cas de norovirus en 2024 souligne l’importance de stratégies de détection robustes dans l’industrie alimentaire. L’utilisation de méthodes avancées basées sur la PCR, associées à des protocoles de préparation d’ARN adaptés, peut améliorer considérablement la précision de la détection des norovirus dans divers produits alimentaires. Alors que l’industrie continue de s’adapter aux conditions changeantes, le maintien de normes élevées en matière d’analyse de la salubrité des aliments sera essentiel pour gérer et réduire le risque d’éclosions de norovirus.