12/08/2020

Extraction semi-automatisée des ADN pour des analyses PCR améliorées et simplifiées !

L’extraction de l’ADN est une partie essentielle de l’analyse PCR en temps réel. Elle est souvent difficile en raison de plusieurs facteurs tels que la grande variabilité des matrices alimentaires et la présence de substances inhibitrices comme les ingrédients végétaux, les alcools ou encore les sels.

Pour être efficace, l’extraction des ADN comporte plusieurs étapes:

1. Lyse cellulaire et des tissues
2. Adsorption des ADN
3. Lavage
4. Elution

Les méthodes manuelles d’extraction des ADN sont souvent laborieuses et chronophages. De plus, les résultats dépendent entre autres de la nature de l’échantillon et de l’expérience du personnel de laboratoire.

Les solutions d’extraction automatisées aident à simplifier et à augmenter le rendement d’extraction des ADN. Elles ne diminuent pas seulement les coûts de main-d’œuvre technique, elles augmentent également l’efficacité et la qualité de l’extraction et aident à normaliser et harmoniser les méthodes. Toutefois, les systèmes automatisés doivent également répondre à d’autres exigences, telles que la reproductibilité des résultats, des contaminations croisées minimales et, bien sûr, une facilité d’utilisation.

Utilisez un seul kit d’extraction pour un large éventail de matrices alimentaires: le nouveau kit SureFast® Mag PREP Food (F1060) est destiné à l’extraction de l’ADN animal, végétal et bactérien à partir d’échantillons alimentaires ou d’un pré-enrichissement en combinaison avec l’appareil TANBead Maelstrom™ 8 Autostage (ZMAL8).

La technologie, basée sur l’extraction des ADN à l’aide de billes magnétiques, permet de traiter jusqu’à huit échantillons en même temps. Pour l’extraction des ARN, le kit SureFast® Mag PREP (F1062) sera prochainement disponible.

Il n’y a que trois étapes à effectuer lors de l’utilisation de la solution R-Biopharm pour la préparation des ADN :

1. Lyse: ajouter les réactifs à l’échantillon, homogénéiser et incuber sous agitation permanente dans un thermo-mixer.
2. Transférer le surnageant sur la plaque de puits pré-remplis.
3. Disposer la plaque sur la plate-forme TANBead M8 Autostage puis appuyer sur START.

https://www.youtube.com/watch?v=6B7d5RVkD5Q&t=

Dans une étude approfondie, réalisée par le laboratoire Congen, des matrices alimentaires ont été analysées en comparant les méthodes d’extraction : “spin-filter” et billes magnétiques. Les résultats ont montré des écarts de valeurs sur l’amplification de 1 à 2cp entre les deux méthodes. Ce qui signifie que pour certaines matrices de meilleurs résultats PCR ont été observés avec l’extraction des ADN sur billes magnétique.

Voir l'étude